[article] 
inHygiènes > 29 (6) [02/12/2021] . - pp. 365-371

Titre :	SARS-CoV-2 : actualités des variants et implications épidémiologiques et cliniques
Type de document :	texte imprimé
Auteurs :	Slim FOURATI, Auteur
Année de publication :	2021
Article en page(s) :	pp. 365-371
Catégories :	Anatomie:Système immunitaire:Anticorps Anatomie:Tissu:Cellule:ARN Chimie:Composé chimique:Composé organique:Protéine Environnement & matières [NI]:Produit [NI]:Produit défini par l'effet [NI]:Agent CMR:Mutagène Information épidémiologique:Recueil données:Surveillance épidémiologique Mots outils [NI]:Méthodologie:Evaluation:Impact Mots outils [NI]:Méthodologie:Processus:Diffusion Mots outils [NI]:Méthodologie:Processus:Evolution Organisme vivant:Microorganisme:Virus Phénomène épidémiologique:Contagion Phénomène épidémiologique:Contamination Phénomène épidémiologique:Epidémie Politique santé:Prévention santé:Prophylaxie:Prévention maladie transmissible:Vaccination Pratique médicale:Recherche médicale:Epidémiologie Spécialité [NI]:Spécialité médicale:Biologie:Génétique Spécialité [NI]:Spécialité médicale:Biologie:Microbiologie:Virologie
Résumé :	Le SARS-CoV-2 est un virus enveloppé dont le génome est constitué d’ARN simple brin, de polarité positive d’environ 30000 nucléotides. La protéine S (Spike) de surface se lie au récepteur cellulaire ACE2 qui est exprimé dans de nombreux tissus. Elle comprend deux sous-unités, S1 et S2, S1 contenant la région N-terminale (NTD) et le domaine de liaison au récepteur (RBD, receptor binding domain). Les mutations adaptatives du SARS-CoV-2 concernent principalement la protéine Spike et plus particulièrement les domaines RBD et NTD. Plusieurs de ces mutations ont été sélectionnées dans des lignages viraux indépendants ayant émergé dans différentes régions du globe. Ce phénomène est appelé convergence évolutive. Aujourd’hui, le variant Delta (δ) est progressivement remplacé par Omicron en France et dans le monde. Le variant Omicron B.1.1529, porteur d’une trentaine de mutations dans Spike, est détecté dès début novembre en Afrique du Sud, et au Botswana et se répand progressivement dans le reste du monde. D’autre part, le variant B.1.640 identifié au début du mois d’octobre en Bretagne et en Ile-de-France est également détecté de manière sporadique. La circulation continue du SARS-CoV-2 dans le monde, en particulier dans les pays où la vaccination n’est pas suffisamment étendue, fera inévitablement le lit de nouveaux variants nécessitant de renforcer la surveillance génotypique et phénotypique des virus circulants dans le monde.
Localisation OPAC :	Montbrison/St-Chamond
Support (OPAC) :	Article de revue / En ligne (Abo. IFSI)

[article] SARS-CoV-2 : actualités des variants et implications épidémiologiques et cliniques [texte imprimé] / Slim FOURATI, Auteur . - 2021 . - pp. 365-371.
in Hygiènes > 29 (6) [02/12/2021] . - pp. 365-371

Catégories :	Anatomie:Système immunitaire:Anticorps Anatomie:Tissu:Cellule:ARN Chimie:Composé chimique:Composé organique:Protéine Environnement & matières [NI]:Produit [NI]:Produit défini par l'effet [NI]:Agent CMR:Mutagène Information épidémiologique:Recueil données:Surveillance épidémiologique Mots outils [NI]:Méthodologie:Evaluation:Impact Mots outils [NI]:Méthodologie:Processus:Diffusion Mots outils [NI]:Méthodologie:Processus:Evolution Organisme vivant:Microorganisme:Virus Phénomène épidémiologique:Contagion Phénomène épidémiologique:Contamination Phénomène épidémiologique:Epidémie Politique santé:Prévention santé:Prophylaxie:Prévention maladie transmissible:Vaccination Pratique médicale:Recherche médicale:Epidémiologie Spécialité [NI]:Spécialité médicale:Biologie:Génétique Spécialité [NI]:Spécialité médicale:Biologie:Microbiologie:Virologie
Résumé :	Le SARS-CoV-2 est un virus enveloppé dont le génome est constitué d’ARN simple brin, de polarité positive d’environ 30000 nucléotides. La protéine S (Spike) de surface se lie au récepteur cellulaire ACE2 qui est exprimé dans de nombreux tissus. Elle comprend deux sous-unités, S1 et S2, S1 contenant la région N-terminale (NTD) et le domaine de liaison au récepteur (RBD, receptor binding domain). Les mutations adaptatives du SARS-CoV-2 concernent principalement la protéine Spike et plus particulièrement les domaines RBD et NTD. Plusieurs de ces mutations ont été sélectionnées dans des lignages viraux indépendants ayant émergé dans différentes régions du globe. Ce phénomène est appelé convergence évolutive. Aujourd’hui, le variant Delta (δ) est progressivement remplacé par Omicron en France et dans le monde. Le variant Omicron B.1.1529, porteur d’une trentaine de mutations dans Spike, est détecté dès début novembre en Afrique du Sud, et au Botswana et se répand progressivement dans le reste du monde. D’autre part, le variant B.1.640 identifié au début du mois d’octobre en Bretagne et en Ile-de-France est également détecté de manière sporadique. La circulation continue du SARS-CoV-2 dans le monde, en particulier dans les pays où la vaccination n’est pas suffisamment étendue, fera inévitablement le lit de nouveaux variants nécessitant de renforcer la surveillance génotypique et phénotypique des virus circulants dans le monde.
Localisation OPAC :	Montbrison/St-Chamond
Support (OPAC) :	Article de revue / En ligne (Abo. IFSI)