Contribution de l’analyse moléculaire à l’investigation d’un cluster de Covid-19 en long séjour gériatrique / Jean-Winoc Decousser in Hygiènes, 29 (4) ([02/09/2021])

Public ISBD [article]  inHygiènes > 29 (4) [02/09/2021] . - pp. 261-268 Titre : Contribution de l’analyse moléculaire à l’investigation d’un cluster de Covid-19 en long séjour gériatrique Type de document : texte imprimé Auteurs : Jean-Winoc Decousser, Auteur ; Céline SAKR, Auteur ; Audrey MAURAND, Auteur ; et al. Année de publication : 2021 Article en page(s) : pp. 261-268 Catégories : Information & communication [NI]:Information:Nature information [NI]:Etude:Etude comparée ; Information & communication [NI]:Information:Nature information [NI]:Etude:Etude prospective ; Méthode épidémiologique:Enquête épidémiologique ; Mots outils [NI]:Méthodologie:Analyse ; Phénomène épidémiologique:Contagion ; Phénomène épidémiologique:Epidémie ; Pratique médicale:Recherche médicale:Epidémiologie ; Pratique médicale:Visite ; Profession sanitaire & sociale:Profession santé:Profession paramédicale:Soignant informel ; Soins:Hygiène hospitalière ; Soins:Soins infirmiers:Processus soins:Organisation soins:Equipe soins ; Spécialité [NI]:Spécialité médicale:Gériatrie ; Travail:Management:Organisation travail:Travail équipe:Travail pluridisciplinaire ; ~termes orphelins:Patient Résumé : Contexte et objectif. La lutte contre la Covid-19 nécessite l’identification des événements et acteurs de transmission. L’objectif de cette étude est de montrer la complémentarité de l’approche épidémiologique classique et de l’approche moléculaire par séquençage et comparaison des souches de Sars-CoV-2. Les performances et limites de ces méthodes sont évaluées. Méthodes. L’investigation épidémiologique classique d’un cluster en long séjour gériatrique a été réalisée en se focalisant sur la disponibilité des données. En parallèle, les souches de Sars-CoV-2 retrouvées chez les patients ont été séquencées, caractérisées phylogénétiquement et comparées. Résultats. Le cluster a impliqué 29 patients et 6 soignants entre le 26/12/2020 et le 25/01/2021 dans un service de long séjour gériatrique composé de deux unités. L’étude épidémiologique a montré une contamination secondaire des soignants auprès des patients et l’indisponibilité de certaines informations nécessaires à la compréhension des transmissions (entraide des soignants entre unités, interventions des médecins de garde, plans de table des repas partagés…). Les 18 séquences analysables ont mis en évidence une souche dérivant de la souche ancestrale Wuhan, et 4 groupes de séquences identiques entre elles séparées par une à deux différences nucléotidiques. L’apparition de mutations a permis d’identifier et d’exclure des voies de transmission (deux voisins de chambre présentant deux souches différentes). Une souche très divergente (25 différences) a été identifiée en fin d’épidémie au sein du cluster, soulignant le risque de la multiplication des séries de dépistage. Conclusion. Une stratégie combinant une investigation épidémiologique basique et une comparaison moléculaire des souches permettrait d’économiser les forces des hygiénistes. Localisation OPAC : Montbrison/St-Chamond Support (OPAC) : Article de revue / En ligne (Abo. IFSI) [article] Contribution de l’analyse moléculaire à l’investigation d’un cluster de Covid-19 en long séjour gériatrique [texte imprimé] / Jean-Winoc Decousser, Auteur ; Céline SAKR, Auteur ; Audrey MAURAND, Auteur ; et al. . - 2021 . - pp. 261-268. in Hygiènes > 29 (4) [02/09/2021] . - pp. 261-268 Catégories : Information & communication [NI]:Information:Nature information [NI]:Etude:Etude comparée ; Information & communication [NI]:Information:Nature information [NI]:Etude:Etude prospective ; Méthode épidémiologique:Enquête épidémiologique ; Mots outils [NI]:Méthodologie:Analyse ; Phénomène épidémiologique:Contagion ; Phénomène épidémiologique:Epidémie ; Pratique médicale:Recherche médicale:Epidémiologie ; Pratique médicale:Visite ; Profession sanitaire & sociale:Profession santé:Profession paramédicale:Soignant informel ; Soins:Hygiène hospitalière ; Soins:Soins infirmiers:Processus soins:Organisation soins:Equipe soins ; Spécialité [NI]:Spécialité médicale:Gériatrie ; Travail:Management:Organisation travail:Travail équipe:Travail pluridisciplinaire ; ~termes orphelins:Patient Résumé : Contexte et objectif. La lutte contre la Covid-19 nécessite l’identification des événements et acteurs de transmission. L’objectif de cette étude est de montrer la complémentarité de l’approche épidémiologique classique et de l’approche moléculaire par séquençage et comparaison des souches de Sars-CoV-2. Les performances et limites de ces méthodes sont évaluées. Méthodes. L’investigation épidémiologique classique d’un cluster en long séjour gériatrique a été réalisée en se focalisant sur la disponibilité des données. En parallèle, les souches de Sars-CoV-2 retrouvées chez les patients ont été séquencées, caractérisées phylogénétiquement et comparées. Résultats. Le cluster a impliqué 29 patients et 6 soignants entre le 26/12/2020 et le 25/01/2021 dans un service de long séjour gériatrique composé de deux unités. L’étude épidémiologique a montré une contamination secondaire des soignants auprès des patients et l’indisponibilité de certaines informations nécessaires à la compréhension des transmissions (entraide des soignants entre unités, interventions des médecins de garde, plans de table des repas partagés…). Les 18 séquences analysables ont mis en évidence une souche dérivant de la souche ancestrale Wuhan, et 4 groupes de séquences identiques entre elles séparées par une à deux différences nucléotidiques. L’apparition de mutations a permis d’identifier et d’exclure des voies de transmission (deux voisins de chambre présentant deux souches différentes). Une souche très divergente (25 différences) a été identifiée en fin d’épidémie au sein du cluster, soulignant le risque de la multiplication des séries de dépistage. Conclusion. Une stratégie combinant une investigation épidémiologique basique et une comparaison moléculaire des souches permettrait d’économiser les forces des hygiénistes. Localisation OPAC : Montbrison/St-Chamond Support (OPAC) : Article de revue / En ligne (Abo. IFSI)

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MON0000003760	Revue	Revue - [m]	CDTI Montbrison	Revues	Disponible

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