L’antibiogramme / Jean-Winoc Decousser in Hygiènes, 31 (3) (juin 2023)

Public ISBD [article]  inHygiènes > 31 (3) (juin 2023) . - pp. 253-258 Titre : L’antibiogramme : objectifs, méthodes et interprétation Type de document : texte imprimé Auteurs : Jean-Winoc Decousser, Auteur ; Sara Romano-Bertrand, Auteur ; Bruno Pozzetto, Auteur Année de publication : 2023 Article en page(s) : pp. 253-258 Langues : Français (fre) Catégories : ANTIBIOTIQUE Organisme vivant:Microorganisme:Bactérie Pathologie:Infection Politique santé:Promotion santé:Programme santé:Objectif santé Spécialité [NI]:Spécialité médicale:Biologie:Microbiologie Thérapeutique:Thérapeutique médicamenteuse:Médicament:Pharmacorésistance Résumé : Dans ce cinquième volet, nous abordons la question de la place et des limites de l’antibiogramme. Nous discuterons dans une prochaine rubrique les avancées technologiques de l’antibiogramme (antibiogrammes dits « rapides »), ainsi que les tests complémentaires utilisés au laboratoire de bactériologie pour anticiper ou confirmer la présence de résistances acquises aux antibiotiques. L’hygiéniste est confronté dans sa pratique quotidienne au « jargon » des bactériologistes et des infectiologues : il est important qu’il en connaisse et en comprenne les principaux termes afin de mieux en appréhender les apports dans les décisions et recommandations qu’il aura à prendre et à appliquer. Localisation OPAC : Montbrison Support (OPAC) : Article de revue [article] L’antibiogramme : objectifs, méthodes et interprétation [texte imprimé] / Jean-Winoc Decousser, Auteur ; Sara Romano-Bertrand, Auteur ; Bruno Pozzetto, Auteur . - 2023 . - pp. 253-258. Langues : Français (fre) in Hygiènes > 31 (3) (juin 2023) . - pp. 253-258 Catégories : ANTIBIOTIQUE Organisme vivant:Microorganisme:Bactérie Pathologie:Infection Politique santé:Promotion santé:Programme santé:Objectif santé Spécialité [NI]:Spécialité médicale:Biologie:Microbiologie Thérapeutique:Thérapeutique médicamenteuse:Médicament:Pharmacorésistance Résumé : Dans ce cinquième volet, nous abordons la question de la place et des limites de l’antibiogramme. Nous discuterons dans une prochaine rubrique les avancées technologiques de l’antibiogramme (antibiogrammes dits « rapides »), ainsi que les tests complémentaires utilisés au laboratoire de bactériologie pour anticiper ou confirmer la présence de résistances acquises aux antibiotiques. L’hygiéniste est confronté dans sa pratique quotidienne au « jargon » des bactériologistes et des infectiologues : il est important qu’il en connaisse et en comprenne les principaux termes afin de mieux en appréhender les apports dans les décisions et recommandations qu’il aura à prendre et à appliquer. Localisation OPAC : Montbrison Support (OPAC) : Article de revue

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L’antibiogramme / Jean-Winoc Decousser in Hygiènes, 31 (4) (septembre 2023)  

Public ISBD [article]  inHygiènes > 31 (4) (septembre 2023) . - pp.331-337 Titre : L’antibiogramme : techniques rapides et tests complémentaires Type de document : texte imprimé Auteurs : Jean-Winoc Decousser, Auteur ; Bruno Pozzetto, Auteur ; Sara Romano-Bertrand, Auteur Année de publication : 2023 Article en page(s) : pp.331-337 Langues : Français (fre) Catégories : ANTIBIOTIQUE Organisme vivant:Microorganisme:Bactérie Pathologie:Infection Pratique médicale:Test Résumé : Dans le cinquième volet de la rubrique « Du côté du laboratoire », nous avons abordé la place et les limites de l’antibiogramme dit « standard » en soulignant son rôle essentiel dans la prise en charge des infections et notamment dans le choix d’une antibiothérapie adaptée à la fois la plus efficace et la plus respectueuse des microbiotes du patient et de l’écologie bactérienne. Nous en avons également identifié le principal écueil : le délai indispensable à l’obtention de ses résultats. En effet, l’antibiogramme s’effectue sur une culture pure de la bactérie concernée, ce qui nécessite un délai d’au minimum 18 heures après l’ensemencement de l’échantillon clinique pour les micro-organismes à culture rapide. Ensuite, la réalisation de l’antibiogramme classique proprement dit requiert une incubation supplémentaire de 20±4 heures [1]. Entre la réalisation du prélèvement clinique, sa mise en culture au laboratoire et l’obtention des résultats de l’antibiogramme, il s’écoule donc au minimum 48 heures (sans tenir compte du temps de transport). Ce délai est loin d’être négligeable, tant d’un point de vue individuel (adaptation du traitement antibiotique) que collectif (mise en place des précautions d’hygiène adaptées). Il est en effet bien établi que la rapidité de l’obtention de l’information concernant la sensibilité d’une bactérie aux antibiotiques, donc la présence éventuelle de résistance(s) acquise(s), peut s’avérer capitale pour la prise en charge d’un patient : tout retard, à l’heure près, à la mise en place d’une antibiothérapie efficace peut avoir un impact sur la mortalité associée à l’infection, notamment en cas de choc septique [2] ; une désescalade rapide (diminution du spectre de l’antibiothérapie) est souhaitable pour limiter les conséquences d’une antibiothérapie à large spectre sur les dysbioses et l’émergence de résistances acquises. Dans le cadre de la prévention croisée, un retard dans la mise en place des précautions complémentaires adaptées peut être à l’origine de cas secondaires donc d’épidémies [3]. Localisation OPAC : Montbrison Support (OPAC) : Article de revue En ligne : https://www.hygienes.net/publication-scientifique/lantibiogramme-techniques-rapi [...] [article] L’antibiogramme : techniques rapides et tests complémentaires [texte imprimé] / Jean-Winoc Decousser, Auteur ; Bruno Pozzetto, Auteur ; Sara Romano-Bertrand, Auteur . - 2023 . - pp.331-337. Langues : Français (fre) in Hygiènes > 31 (4) (septembre 2023) . - pp.331-337 Catégories : ANTIBIOTIQUE Organisme vivant:Microorganisme:Bactérie Pathologie:Infection Pratique médicale:Test Résumé : Dans le cinquième volet de la rubrique « Du côté du laboratoire », nous avons abordé la place et les limites de l’antibiogramme dit « standard » en soulignant son rôle essentiel dans la prise en charge des infections et notamment dans le choix d’une antibiothérapie adaptée à la fois la plus efficace et la plus respectueuse des microbiotes du patient et de l’écologie bactérienne. Nous en avons également identifié le principal écueil : le délai indispensable à l’obtention de ses résultats. En effet, l’antibiogramme s’effectue sur une culture pure de la bactérie concernée, ce qui nécessite un délai d’au minimum 18 heures après l’ensemencement de l’échantillon clinique pour les micro-organismes à culture rapide. Ensuite, la réalisation de l’antibiogramme classique proprement dit requiert une incubation supplémentaire de 20±4 heures [1]. Entre la réalisation du prélèvement clinique, sa mise en culture au laboratoire et l’obtention des résultats de l’antibiogramme, il s’écoule donc au minimum 48 heures (sans tenir compte du temps de transport). Ce délai est loin d’être négligeable, tant d’un point de vue individuel (adaptation du traitement antibiotique) que collectif (mise en place des précautions d’hygiène adaptées). Il est en effet bien établi que la rapidité de l’obtention de l’information concernant la sensibilité d’une bactérie aux antibiotiques, donc la présence éventuelle de résistance(s) acquise(s), peut s’avérer capitale pour la prise en charge d’un patient : tout retard, à l’heure près, à la mise en place d’une antibiothérapie efficace peut avoir un impact sur la mortalité associée à l’infection, notamment en cas de choc septique [2] ; une désescalade rapide (diminution du spectre de l’antibiothérapie) est souhaitable pour limiter les conséquences d’une antibiothérapie à large spectre sur les dysbioses et l’émergence de résistances acquises. Dans le cadre de la prévention croisée, un retard dans la mise en place des précautions complémentaires adaptées peut être à l’origine de cas secondaires donc d’épidémies [3]. Localisation OPAC : Montbrison Support (OPAC) : Article de revue En ligne : https://www.hygienes.net/publication-scientifique/lantibiogramme-techniques-rapi [...]

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La comparaison et le typage microbien en 2022 / Jean-Winoc Decousser in Hygiènes, 30 (6) (décembre 2022)

Public ISBD [article]  inHygiènes > 30 (6) (décembre 2022) . - pp. 376-381 Titre : La comparaison et le typage microbien en 2022 Type de document : texte imprimé Auteurs : Jean-Winoc Decousser, Auteur Année de publication : 2022 Article en page(s) : pp. 376-381 Langues : Français (fre) Catégories : Information sanitaire:Mesure santé:Indicateur santé:Valeur référence MALADIE VIRALE Mots outils [NI]:Méthodologie:Technique mesure Organisme vivant:Microorganisme Organisme vivant:Microorganisme:Bactérie Phénomène épidémiologique:Contagion Pratique médicale:Recherche médicale:Epidémiologie Soins:Hygiène hospitalière Spécialité [NI]:Spécialité médicale:Biologie:Microbiologie Variable épidémiologique:Risque:Facteur risque:Exposition Résumé : Pour ce second volet, nous allons aborder les techniques de typage et de comparaison de souches microbiennes disponibles et utilisées en 2022. Historiquement, la comparaison des souches ou isolats a concerné très majoritairement les bactéries : les techniques, nombreuses quoique le plus souvent artisanales (dites « maison »), étaient relativement faciles d’accès. Leur interprétation était néanmoins difficile et leurs résultats variables selon les laboratoires. Certaines approches étaient pourtant standardisées, certains fabricants de réactifs de laboratoire commercialisant des trousses prêtes à l’emploi voire des solutions complètement intégrées. Concernant les virus, la comparaison des isolats viraux a très longtemps été réservée aux centres de référence qui utilisaient la technique de séquençage d’un gène ou d’une partie précise du génome viral. La pandémie de SARS–CoV-21 a démocratisé le séquençage donc le typage des isolats et les comparaisons inter-échantillons des séquences d’intérêt. Pour les champignons et les parasites, les difficultés de réalisation et d’interprétation ont conduit à réserver cette activité aux centres hyperspécialisés et notamment aux centres nationaux de référence. Ce domaine de la microbiologie a connu sa révolution au début des années 2000 avec l’apparition, le développement puis la diffusion des techniques de séquençage de nouvelle génération (Next generation sequencing [NGS]) [1]. Ces techniques permettent de séquencer en même temps une grande quantité de matériel génétique pour ensuite reconstruire tout ou partie du génome des micro-organismes. La « déferlante » du NGS a tout emporté sur son passage et, au moins pour les bactéries, a remplacé la quasi-totalité des autres méthodes de comparaison des souches. Nous aurons l’occasion dans un prochain article de revenir sur la révolution technique apportée par le NGS. Localisation OPAC : Montbrison Support (OPAC) : Article de revue [article] La comparaison et le typage microbien en 2022 [texte imprimé] / Jean-Winoc Decousser, Auteur . - 2022 . - pp. 376-381. Langues : Français (fre) in Hygiènes > 30 (6) (décembre 2022) . - pp. 376-381 Catégories : Information sanitaire:Mesure santé:Indicateur santé:Valeur référence MALADIE VIRALE Mots outils [NI]:Méthodologie:Technique mesure Organisme vivant:Microorganisme Organisme vivant:Microorganisme:Bactérie Phénomène épidémiologique:Contagion Pratique médicale:Recherche médicale:Epidémiologie Soins:Hygiène hospitalière Spécialité [NI]:Spécialité médicale:Biologie:Microbiologie Variable épidémiologique:Risque:Facteur risque:Exposition Résumé : Pour ce second volet, nous allons aborder les techniques de typage et de comparaison de souches microbiennes disponibles et utilisées en 2022. Historiquement, la comparaison des souches ou isolats a concerné très majoritairement les bactéries : les techniques, nombreuses quoique le plus souvent artisanales (dites « maison »), étaient relativement faciles d’accès. Leur interprétation était néanmoins difficile et leurs résultats variables selon les laboratoires. Certaines approches étaient pourtant standardisées, certains fabricants de réactifs de laboratoire commercialisant des trousses prêtes à l’emploi voire des solutions complètement intégrées. Concernant les virus, la comparaison des isolats viraux a très longtemps été réservée aux centres de référence qui utilisaient la technique de séquençage d’un gène ou d’une partie précise du génome viral. La pandémie de SARS–CoV-21 a démocratisé le séquençage donc le typage des isolats et les comparaisons inter-échantillons des séquences d’intérêt. Pour les champignons et les parasites, les difficultés de réalisation et d’interprétation ont conduit à réserver cette activité aux centres hyperspécialisés et notamment aux centres nationaux de référence. Ce domaine de la microbiologie a connu sa révolution au début des années 2000 avec l’apparition, le développement puis la diffusion des techniques de séquençage de nouvelle génération (Next generation sequencing [NGS]) [1]. Ces techniques permettent de séquencer en même temps une grande quantité de matériel génétique pour ensuite reconstruire tout ou partie du génome des micro-organismes. La « déferlante » du NGS a tout emporté sur son passage et, au moins pour les bactéries, a remplacé la quasi-totalité des autres méthodes de comparaison des souches. Nous aurons l’occasion dans un prochain article de revenir sur la révolution technique apportée par le NGS. Localisation OPAC : Montbrison Support (OPAC) : Article de revue

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Contribution de l’analyse moléculaire à l’investigation d’un cluster de Covid-19 en long séjour gériatrique / Jean-Winoc Decousser in Hygiènes, 29 (4) ([02/09/2021])

Public ISBD [article]  inHygiènes > 29 (4) [02/09/2021] . - pp. 261-268 Titre : Contribution de l’analyse moléculaire à l’investigation d’un cluster de Covid-19 en long séjour gériatrique Type de document : texte imprimé Auteurs : Jean-Winoc Decousser, Auteur ; Céline SAKR, Auteur ; Audrey MAURAND, Auteur ; et al. Année de publication : 2021 Article en page(s) : pp. 261-268 Catégories : Information & communication [NI]:Information:Nature information [NI]:Etude:Etude comparée Information & communication [NI]:Information:Nature information [NI]:Etude:Etude prospective Méthode épidémiologique:Enquête épidémiologique Mots outils [NI]:Méthodologie:Analyse Phénomène épidémiologique:Contagion Phénomène épidémiologique:Epidémie Pratique médicale:Recherche médicale:Epidémiologie Pratique médicale:Visite Profession sanitaire & sociale:Profession santé:Profession paramédicale:Soignant informel Soins:Hygiène hospitalière Soins:Soins infirmiers:Processus soins:Organisation soins:Equipe soins Spécialité [NI]:Spécialité médicale:Gériatrie Travail:Management:Organisation travail:Travail équipe:Travail pluridisciplinaire ~termes orphelins:Patient Résumé : Contexte et objectif. La lutte contre la Covid-19 nécessite l’identification des événements et acteurs de transmission. L’objectif de cette étude est de montrer la complémentarité de l’approche épidémiologique classique et de l’approche moléculaire par séquençage et comparaison des souches de Sars-CoV-2. Les performances et limites de ces méthodes sont évaluées. Méthodes. L’investigation épidémiologique classique d’un cluster en long séjour gériatrique a été réalisée en se focalisant sur la disponibilité des données. En parallèle, les souches de Sars-CoV-2 retrouvées chez les patients ont été séquencées, caractérisées phylogénétiquement et comparées. Résultats. Le cluster a impliqué 29 patients et 6 soignants entre le 26/12/2020 et le 25/01/2021 dans un service de long séjour gériatrique composé de deux unités. L’étude épidémiologique a montré une contamination secondaire des soignants auprès des patients et l’indisponibilité de certaines informations nécessaires à la compréhension des transmissions (entraide des soignants entre unités, interventions des médecins de garde, plans de table des repas partagés…). Les 18 séquences analysables ont mis en évidence une souche dérivant de la souche ancestrale Wuhan, et 4 groupes de séquences identiques entre elles séparées par une à deux différences nucléotidiques. L’apparition de mutations a permis d’identifier et d’exclure des voies de transmission (deux voisins de chambre présentant deux souches différentes). Une souche très divergente (25 différences) a été identifiée en fin d’épidémie au sein du cluster, soulignant le risque de la multiplication des séries de dépistage. Conclusion. Une stratégie combinant une investigation épidémiologique basique et une comparaison moléculaire des souches permettrait d’économiser les forces des hygiénistes. Localisation OPAC : Montbrison/St-Chamond Support (OPAC) : Article de revue / En ligne (Abo. IFSI) [article] Contribution de l’analyse moléculaire à l’investigation d’un cluster de Covid-19 en long séjour gériatrique [texte imprimé] / Jean-Winoc Decousser, Auteur ; Céline SAKR, Auteur ; Audrey MAURAND, Auteur ; et al. . - 2021 . - pp. 261-268. in Hygiènes > 29 (4) [02/09/2021] . - pp. 261-268 Catégories : Information & communication [NI]:Information:Nature information [NI]:Etude:Etude comparée Information & communication [NI]:Information:Nature information [NI]:Etude:Etude prospective Méthode épidémiologique:Enquête épidémiologique Mots outils [NI]:Méthodologie:Analyse Phénomène épidémiologique:Contagion Phénomène épidémiologique:Epidémie Pratique médicale:Recherche médicale:Epidémiologie Pratique médicale:Visite Profession sanitaire & sociale:Profession santé:Profession paramédicale:Soignant informel Soins:Hygiène hospitalière Soins:Soins infirmiers:Processus soins:Organisation soins:Equipe soins Spécialité [NI]:Spécialité médicale:Gériatrie Travail:Management:Organisation travail:Travail équipe:Travail pluridisciplinaire ~termes orphelins:Patient Résumé : Contexte et objectif. La lutte contre la Covid-19 nécessite l’identification des événements et acteurs de transmission. L’objectif de cette étude est de montrer la complémentarité de l’approche épidémiologique classique et de l’approche moléculaire par séquençage et comparaison des souches de Sars-CoV-2. Les performances et limites de ces méthodes sont évaluées. Méthodes. L’investigation épidémiologique classique d’un cluster en long séjour gériatrique a été réalisée en se focalisant sur la disponibilité des données. En parallèle, les souches de Sars-CoV-2 retrouvées chez les patients ont été séquencées, caractérisées phylogénétiquement et comparées. Résultats. Le cluster a impliqué 29 patients et 6 soignants entre le 26/12/2020 et le 25/01/2021 dans un service de long séjour gériatrique composé de deux unités. L’étude épidémiologique a montré une contamination secondaire des soignants auprès des patients et l’indisponibilité de certaines informations nécessaires à la compréhension des transmissions (entraide des soignants entre unités, interventions des médecins de garde, plans de table des repas partagés…). Les 18 séquences analysables ont mis en évidence une souche dérivant de la souche ancestrale Wuhan, et 4 groupes de séquences identiques entre elles séparées par une à deux différences nucléotidiques. L’apparition de mutations a permis d’identifier et d’exclure des voies de transmission (deux voisins de chambre présentant deux souches différentes). Une souche très divergente (25 différences) a été identifiée en fin d’épidémie au sein du cluster, soulignant le risque de la multiplication des séries de dépistage. Conclusion. Une stratégie combinant une investigation épidémiologique basique et une comparaison moléculaire des souches permettrait d’économiser les forces des hygiénistes. Localisation OPAC : Montbrison/St-Chamond Support (OPAC) : Article de revue / En ligne (Abo. IFSI)

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Les déterminants de l’usage des gants en établissement d’hébergement pour personnes âgées dépendantes / Jean-Winoc Decousser in Hygiènes, 31 (1) (mars 2023)

Public ISBD [article]  inHygiènes > 31 (1) (mars 2023) . - pp. 39-44 Titre : Les déterminants de l’usage des gants en établissement d’hébergement pour personnes âgées dépendantes Type de document : texte imprimé Auteurs : Jean-Winoc Decousser, Auteur ; Émilie PERCHAT, Auteur ; Sarah PUDEWIL, Auteur ; et al. Année de publication : 2023 Article en page(s) : pp. 39-44 Langues : Français (fre) Catégories : DISPOSITIF A USAGE UNIQUE ETABLISSEMENT D'HEBERGEMENT POUR PERSONNE AGEE DEPENDANTE ETUDE GENERALE Pratique santé [NI]:Comportement santé:Hygiène Sciences éducation:Pédagogie:Processus apprentissage:Compétence Résumé : Dans les établissements d’hébergement pour personnes âgées dépendantes (Ehpad), le personnel intervenant auprès des résidents est issu de formations variées. Cette étude a pour objectif d’évaluer les déterminants du mésusage du port des gants en fonction des acteurs du soin en Ehpad. Localisation OPAC : Montbrison Support (OPAC) : Article de revue [article] Les déterminants de l’usage des gants en établissement d’hébergement pour personnes âgées dépendantes [texte imprimé] / Jean-Winoc Decousser, Auteur ; Émilie PERCHAT, Auteur ; Sarah PUDEWIL, Auteur ; et al. . - 2023 . - pp. 39-44. Langues : Français (fre) in Hygiènes > 31 (1) (mars 2023) . - pp. 39-44 Catégories : DISPOSITIF A USAGE UNIQUE ETABLISSEMENT D'HEBERGEMENT POUR PERSONNE AGEE DEPENDANTE ETUDE GENERALE Pratique santé [NI]:Comportement santé:Hygiène Sciences éducation:Pédagogie:Processus apprentissage:Compétence Résumé : Dans les établissements d’hébergement pour personnes âgées dépendantes (Ehpad), le personnel intervenant auprès des résidents est issu de formations variées. Cette étude a pour objectif d’évaluer les déterminants du mésusage du port des gants en fonction des acteurs du soin en Ehpad. Localisation OPAC : Montbrison Support (OPAC) : Article de revue

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Diagnostic et prise en charge des diarrhées à Clostridioides difficile / Jean-Winoc Decousser in Hygiènes, 32 (1) (mars 2024)  

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Diagnostic virologique des infections respiratoires dans la phase post-Covid-19 / Bruno Pozzetto in Hygiènes, 31 (5) (novembre 2023)  

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Équipements de protection individuelle – Stratégie d’adaptation en situation de pénurie / Jean-Winoc Decousser

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Équipements de protection individuelle – Stratégie d’adaptation en situation de pénurie / Jean-Winoc Decousser in Hygiènes, 29 (5) ([02/11/2021])

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Gestion des infections respiratoires à l’hôpital à l’ère de la Covid-19 / Jean-Winoc Decousser in Hygiènes, 31 (4) (septembre 2023)  

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Maîtrise du risque infectieux lié aux légionelles / Jean-Winoc Decousser in Hygiènes, 31 (2) (avril 2023)

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Les prélèvements de surface pour la recherche ciblée de micro-organismes spécifiques / Jean-Winoc Decousser in Hygiènes, 31 (1) (mars 2023)

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Pseudomonas aeruginosa / Sara Romano-Bertrand in Hygiènes, 32 (3) (juin 2024)

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Les tests d’amplification en chaîne par polymérase (PCR) multiplexes et les panels syndromiques / Jean-Winoc Decousser in Hygiènes, 30 (4) ([01/09/2022])

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Transmissions d'entérobactéries productrices de carbapénèmases lors de cholangiopancréatographies rétrogrades endoscopiques : limite des prélèvements microbiologiques environnementaux et contribution du séquençage de nouvelle génération / Jean-Winoc Decousser in Hygiènes, 27 (3) (juin 2019)

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